Sí, podés. Hay dos formas según tu caso:
Si tenés varios CUITs propios: sumalos desde WhatsApp en Más opciones → Agregar CUIT.
Si sos contador y trabajás con clientes: registrate como contador y administralos desde una cuenta dedicada.
En cualquiera de los dos casos podés facturar hasta 100 CUITs desde la misma cuenta. Si necesitás más, escribinos por WhatsApp y lo coordinamos.
Al agregar un CUIT, vas a poder elegir el CUIT que queres que cree la factura o subir un unico excel con las ventas de tus clientes y facturarlas todas juntas